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判断短信是由主卡还是副卡发送的，一般可以通过以下几种方式。
1、号码识别：如果副卡的号码与主卡的号码有明显的区别（例如带有特定的前缀或后缀），可以通过识别号码来确定短信的发送方。
2、短信内容：部分短信可能会直接在内容中表明是由主卡还是副卡发送。
3、运营商或银行服务：如果是通过运营商或银行的服务发送的短信，可以尝试联系相关服务商查询发送记录。
4、手机应用或系统提示：部分手机在接收短信时会有特定的提示音或标识，表明短信的来源。
5、询问相关人士：如果仍然无法确定，可以联系相关的服务提供商、运营商或手机制造商的客服部门，或者询问可能知道情况的朋友或家人。
具体的判断方式可能因不同的手机型号、运营商或服务而有所不同，个人隐私很重要，在查看或询问他人手机短信时，请确保得到对方的许可。